安装指南¶
Linux 平台安装 VMD¶
在下载页面，我们发现有6个linux版本的VMD：
LINUX_64 OpenGL, CUDA, OptiX, OSPRay
特点: 支持 OpenGL 显示、CUDA GPU 加速、OptiX GPU 光线追踪渲染、OSPRay CPU 光线追踪渲染。这是功能最全的版本，适用于配有 NVIDIA GPU 的系统，能最大限度地利用 GPU 和光线追踪渲染加速。
适合对象: 如果你的系统配有 NVIDIA GPU，并且你需要使用 GPU 加速或光线追踪渲染（如 OptiX 或 OSPRay），请选择此版本。
LINUX_64 Text-mode w/ EGL
特点: 提供文本模式支持，使用 EGL 来管理无窗口的 OpenGL 渲染。适用于不需要图形界面的计算环境，但仍需要 OpenGL 功能。
适合对象: 如果你使用 VMD 进行命令行操作，但需要 OpenGL 的支持且没有窗口环境（如服务器上），选择此版本。
LINUX_64 Text-mode
特点: 这是一个仅提供文本模式的版本，专为不需要图形界面的用户设计。
适合对象: 如果你主要在命令行环境下运行 VMD 而不需要图形界面，选择此版本。适用于远程服务器或不依赖 GUI 的情况。
LINUX MIC-AVX512 Text-mode
特点: 针对 Intel Xeon Phi MIC 架构和 AVX-512 指令集优化，运行于文本模式，并支持 OSPRay 光线追踪。
适合对象: 如果你在 Intel Xeon Phi 微架构上运行，并且不需要图形界面，选择此版本。它利用了 Xeon Phi 的高并行计算能力。
LINUX MIC-AVX512, OpenGL, CUDA, OptiX, OSPRay
特点: 针对 Intel Xeon Phi MIC 架构的版本，支持 OpenGL、CUDA、OptiX 和 OSPRay，功能最全面。
适合对象: 如果你的系统配备 Intel Xeon Phi 并且需要图形加速、CUDA 支持和光线追踪渲染，选择这个版本。
LINUX OpenPOWER Text-mode
特点: 针对 IBM OpenPOWER 架构优化的文本模式版本，适用于不需要图形界面的环境。
适合对象: 如果你在 IBM OpenPOWER 系统上运行 VMD 且不需要图形界面，选择此版本。
目前主流的是Intel/AMD 64 位处理器，我们主要使用的就是VMD的图形界面，
因此我们下载 vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz 。
安装过程：
step1 注册和下载可执行程序 vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz 。
百度网盘下载： 通过网盘分享的文件： vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz
链接：https://pan.baidu.com/s/1lJkvGF5t_u_Lz2nj2x37ZQ?pwd=y4h9
step2 解压程序
tar -vxzf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz
cd vmd-1.9.3
step3 根据需要修改 configure 文件中的变量install_bin_dir 和 install_library_dir
默认是 $install_bin_dir=”/usr/local/bin” 和 $install_library_dir=”/usr/local/lib/$install_name”
如果你有root权限，希望安装安装的VMD给所有用户使用，则不需要修改configure 文件。
如果你没有root权限，则可以修改按照如下方式修改路径到你用户路径下面，假设用户名是zqchen
$install_bin_dir="/home/zqchen/vmd1.9.3"
$install_library_dir="/home/zqchen/vmd1.9.3/lib/$install_name"
建议使用root 权限安装, 不需要修改configure 文件。
step4 运行 ./confiure 命令生成MakeFile文件
先尝试VMD的基本功能，仅仅配置最LINUXAMD64 必选项
./confiugre LINUXAMD64。[建议]
也可以同时配置其他功能，比如PYTHON ./configure LINUXAMD64 PYTHON。
安装全功能的VMD, ./configure [建议]
第一次使用，可以仅仅配置LINUXAMD64
./configure LINUXAMD64
cd src
注解
在**src文件**下就可以看到MakeFile文件。
step5 安装vmd
sudo make install
step6 配置环境 运行 vmd
添加安装路径 $install_bin_dir 到你的环境变量path中。
默认安装路径在环境变量PATH中。
vmd
我们可以看到VMD正常启动，包含3个窗口：
1. VMD OpenGL Display 窗口
2. VMD Main 窗口
3. VMD 命令窗口。
如下图所示。